Mescid, Haydar Baba Caddesi ile Baba Haydar Camii Sokağı'nın birleştiği yerde ve sokağın sağ köşesindedir. Her iki yola açılan kapıları vardır. Haydar Baba Caddesi'ne açılan merdivenli bir yoldan caminin avlusuna girilir. Sol taraftaki hacet penceresi arkasında Haydar Baba’nın kabri vardır.

Pencerenin yanında şu kitabe bulunmaktadır:

Hazâ mezar-ı sâtı'ül-envar kutb'ül-ebrar ve'l-ahyâr /

Hazret-i Baba Haydar'en-nakşibendi min hülefâi Hazret-i Hace/

Ahrar-ı Semerkandi Kuddise Allahii sırr-ı he-kâtufi. Ft

957 (1550) Kabri üzerindeki kitabesi şudur:

Kutb'ül-ebrâr ve'l-ahyar Baba Haydar'en-Nakşibendi es Semerkandi Hazretleri'nin merkad-i münevverleridir ki/Aziz-i müşa'rünileyh ekâbir-i hacegân-ı Nakşibendiyye'den Hace Ubeydullah Ahrar Hazretleri'nin/hülefâyı kiramından olup dokuzyüz elliyedi tarihinde irtihal-i dâr-ı beka buyurmuşlardır. Kuddise Sırruh/957.

Kitabe, Aziz ketebesini taşımaktadır.

Ahşap son cemaat yerinin geniş saçağını payandalar taşımaktadır. Minaresi sağda olup şerefesinin etrafı demir parmaklıktır. Caddeye göre set üzerinde bulunan mabet kare planlı, kargir, çatışı ve minberi ahşaptır. Alt üst pencerelerden ışık alır. Hiç bir yerinde kitabesi yoktur.

Hadikat'ül-Cevâmi'de bu mabet hakkında bu bilgi vardır:

"Banisi, Sultan Süleyman Hân Hazretleri'dir. Baba Haydar için uğur saydığı için yaptırmıştır. Bu Haydar Baba, Ubeydullah Ahrar Hazretleri'nden mustahlef olup 40 sene kadar beher Ramazan-ı şerifte Eyüp Camii şerifinde itikaf eylemiştir. Kanuni, bu zatın hâline vakıf olduğundan gönlünü hoş etmek üzere mescidi inşa ettirmiştir. Minberini Arpacı Hayreddin Mescidi imamı şeyh Abdullah Efendi, Sultan III. Mustafa Hân zamanında (1757-1774) koymuştur. Bu mescidin mahallesi vardır."

Mescidin oldukça büyük bir haziresi mevcuttur. Burada tarih sırasına göre bu kimseler metfundur: 1046 (1636) Tarihinde vefat eden Hoca Fazlullah ibn-i Hoca Mehmed Sa'id ibn-i Mehmed Abd'üssemi el-Hüseyni Efendi. Taşında, "eş-Şeyh Emir Ahmed el-Buhari Şeyhi" olduğu yazılıdır. 1080 (1669) Hoca Abdullah ibn-i Hoca Fazlullah Efendi.

"Emir Ahmed el-Buhari Şeyhi".

1088 (1677) Eş-Şeyh Abdullah Efendi.

1097 (1686) Şerife Emetullah Hâtûn, fi evâsıt-ı şaban.

1105 (1693) Mehmed Ağa.

1125 (1713) Es-Seyyid Ahmed Efendi.

1131 (1718) Hamzavi taş, Hazret-i Emir Buhari şeyhi es-Seyyid eş-Şeyh Abd'ül-Kebir Efendi.

1132 (1719) Hoca Mehmed Ref'i ibn-i Hoca Abdülkebir Efendi.

1140 (1727) Es-Seyyid Ahmed Ziyâüddin ibn-i Süleyman Efendi.

1176 (1762) Tarik-i Nakşibendi'yyeden es-Seyyid Abdullah Bey.

1187 (1773) Zeliha Hatun bint-i Şeyh Mehmed Efendi.

1187 (1773) rif-i billah, mürşid-i agah, Tekfurdağlı eş-Şeyh Mustafa en-Nakşibendi Kuddise Sırruh. 1188 B. 7(13 Eylül 1774) Eş-Şeyh es-Seyyid Abdurrahman ibn-i Hoca Abdülkebir Efendi. Hankah-ı Şeyh Hazret-i Emir Buhâri. Taşı, Hamzavi olup hattı nefistir.

1191 (1777) İstanbulKazası Bâbı-Zâde es-Seyyid Abdullah Efendi'nin oğlu Mehmed Sa'id Efendi. 1192 (1778) Mehmed Ragıb kethüdası evladından Buhârî Mehmed Mazhar Efendi.

1192 (1778) Dürri-Zâde kethüdası Mehmed Mazhar Efendi'nin kızı Hadice Hanım

1201 (1786) Aşçıbaşı-Zâde Mehmed Sadık Bey'in oğlu İstanbul kazası Bâbı-Zâde torunu ....ullah Efendi.

1203 (1788) Ahmed Efendi Zade Ahmed Ziya Efendi

1205 C. 25 (Ocak 1791) Dürri-Zâde kethüdası Mehmed Mazhar ibn-i Ahmed Ziyâüddin Efendi.

1212 Ramazan 2 (Ağustos 1797) Şeyhülislam Dürri-Zâde kethüdası Mehmed Mazhar Efendi'nin kızı şerife Fâtime Hanım.

1219 (1804) rif-i billah, mürşid-ı agah, Tekfurdağlı Mahmud en-Nakşibendi.

1279 (1862) Rical-i Devlet-i Aliyye'den Mustafa Efendi'nin kethüdası elhac İsmail Efendi'nin kızı Evliya Hanım.

1283 Ca. 3 (Eylül 1866) Mevlevi sikke kabartmalı, el-hac İsmail Efendi'nin oğlu Mehmed Şerafeddin Efendi.

1264 Ramazan 5 Şubat 1848) Mir-i Miran-ı kiramdan Varna Muhafızı elhac Mehmed Ra'if Paşa'nın kerimesi ve Maliye Mektubcusu hulefâsından Ahmed Bey'in zevcesi Şerife Aişe Hanım.

1294 Sad. 5 Şubat 1877) Şahincibaşı elhac İbrahim Ağa'nın kethüdası Şikar-ı Hümâyun Ağası Mehmed Ağa.

Baba Haydar mescidi aynı zamanda âyin günü perşembe olan bir Nakşi Tekkesi idi. Fakat, Şeyh Baba Haydar'dan sonra kimlerin şeyh olduğu belli değildir. Hazirede medfun olan Hoca Mehmed Ref i Efendi'nin, Tekirdağlı Mustafa Efendi'nin ve Şeyh Abdurrahman Efendi'nin burada şeyhlik yaptıkları bilinmektedir.

Tekkenin adı 1199 (1784) tarihli tekkeler listesinde "Baba Haydar Nakşibendi Zaviyesi" diye kayıtlıdır. 1834 tarihinde icra edilen Saliha Sultan Düğünü'ne bu tekke şeyhinin davet edilmeyişi dikkati çekmektedir. 1256 (1840) tarihli tekkeler listesinde ise "Nakşibendiyye'den Baba Haydar Tekkesi" ismi ile yazılıdır. Osman Bey'in 1304 (1886) tarihinde bastırılan Mecmua-i Cevami adlı ese-rinde ise yalnız cami olduğu belirtilmiştir. Oysa 1307 (1890) da bastırılan Mecmua-i Tekaya'da, tekke şeyhinin Niyazi Efendi olduğu kaydedilmiştir. Mabet, 1310 (1892) tarihinde ve Abdülhamid Devri'nde tamir edilmiştir.

Kaynak: (Gezi notu) (A. Münib Mec. Tekaya) (Asitanei Aliyye ve Biladı Selâse'de Kain Tekkeler 1256 ve 1294) (A. Çetin, İstanbuldaki Tekkeler Hakkında, Vakıflar Der. 13/587) (Hadikat'ül-Cevami 1/285) (Koçu, İstanbul Ansiklopedisi 4/1742) Şakaik, Mecdi Ter. S:435) (Osm. Arş. Evkaf)